BOUSQUET Guilhem

CURRICULUM VITAE

BOUSQUET Guilhem

Date de naissance: 4 juin1975, 2 enfants,

Orcid ID: 0000-0001-5594-6694, WoS ResearcherID O-2920-2015

Web site: https://u942inserm.univ-paris13.fr/  

  • FORMATION

1994-2005 : Etudes de médecine (Paris VI) et internat en oncologie (Université de Lille)

2004 : Master 2 (Paris XI, et Institut Curie Pr Louvard)

2005 : Thèse de doctorat en médecine et Diplôme de spécialité en oncologie (Université de Lille)

2011 : Thèse de doctorat en sciences, Université Paris VII, direction Prof. Anne Janin, UMR_S1165.

2013 : Habilitation à Diriger des Recherches en Sciences (HDR), Université Paris VII.

  • FONCTIONS ACTUELLES

2017- : Professeur en oncologie médicale, hôpital Avicenne/Université Sorbonne Paris Nord.

2019- : Chef d’équipe de l’unité MASCOT, puis co-directeur scientifique de l’unité SYNCOMIC (depuis 01/2025, numéro RNSR 202524755D)

Membres de l’équipe : 25 membres incluant 12 femmes*, avec 9 Professeurs de médecine, 1 professeur d’université, 1 MCU-PH, 1 MCF, 1 PHU, 1 ATER, 1 PH, 1 post-doc, 4 étudiants en Thèses, 2 membres de notre Laboratoire International Associé à Shanghaï (Prof ZHAO Weili*, Prof WANG Li*), 3 membres du Centre de Recherche Translationelle contre le Cancer à Ha Noi (DAO Van Tu, NGUYEN Thi Thuy, Bui Thi Oanh).

  • MOBILITE/POST-DOCTORAT

2005-2009: Chef de Clinique Assistant à l’Hôpital Saint-Louis/Université Paris VII

2011-2012: Post-doctorat à l’Institut Pasteur de Lille, Dr P. Lassalle, UMR1004 

2026-2027 : Mission de longue durée (1 an) à l’Académie de Médecine de Buenos Aires, Argentine

  • FORMATION CONTINUE

2011 : Management, Cancéropôle Île-de-France

2012-2013: Diplôme d’Université en expérimentation animale, Paris VI

2016-2017: Diplôme de Management Hospitalier, EMAMH, Ecole des Mines de Paris

02/2026 : Formation BPC-R3 du GIRCI

  • PRIX/RECOMPENSES

2005: Premier prix Guy Michel de la Societé Française d’Oncologie Gynécologique

2006: Bourse de Master de la Fondation pour la Recherche Médicale.

2009: Prix ARTuR de l’Association pour la Recherche sur les Tumeurs Rénales.

2021: PEDR de l’Université Sorbonne Paris Nord

2023: Médaille du Ministère de la Santé au Viet Nam, pour la collaboration franco-vietnamienne, à l’occasion du 100ème anniversaire de l’Institut Curie d’Indochine (novembre 2023, Hanoï).

  • ENCADREMENT D’ETUDIANTS

2012-2025: 27 Master incluant 14 femmes*/4 Thèses dirigées (Morad El Bouchtaoui, défendue mar 2018; Toni Nunes, défendue feb 2019; Eurydice Angeli*, défendue mar 2022 ; Diaddin Hamdan, défense oct 2023)/ 3 Thèses en co-tutelle internationale avec le Viet Nam (Dao VT, défendue nov 2017 : Nguyen TT*, défendue en mar 2024 ; Bui OT*, défendue en 03-2024)/ Supervision de 4 post-doc (Diaddin Hamdan, 2020;Frédéric Pamoukdjian: 2021;Morad El Bouchtaoui, 2019-2022 ; Justine Paris 2023-2024)/ Supervision d’un post-doc international (Dao Van Tu, 2018).

2022- :1 Thèse en cotutelle internationale avec le Viet Nam (MD Hoang, 2024-2027), 1 co-direction de Thèse avec l’UFR de chimie de Jussieu (L Blayac*, 2023-2026), 1 co-direction d’une Thèse de Psychologie avec USPN (D. Allam*, 2025-2028), 1 Thèse en cotutelle internationale avec la Roumanie (C.Pop, 2025-2028), 2 co-directions de Thèse avec E.Angeli (M.Fermaut* et L.Benakila*, 2026-2029), 1Thèse en cotutelle internationale avec l’Argentine (F.Ghegin*, 2026-2029)

  • LECTURES INTERNATIONALES (conférences invité)

“Primary breast sarcomas and phyllode tumors”, Rare Cancer Network meeting, Paris, 2016

“Molecular signature of breast cancer brain metastases” and “Patient-derived xenografts for personalized breast cancer treatment”, Franco-Vietnamese symposium, Ha Noï, Viet Nam, 2017

“Cancer stem-cells and tumor heterogeneity”, Cold Spring Harbor Asia Pacific, Su Zhou, China, 2017

“Resistance to anti-angiogenic drugs”, Experimental Haematology Meeting, Shanghai, China, 2018

“Preclinical development of anticancer drugs”, Dual-Model training course in Vietnam about Clinical Trial Design and Protocol Writing, support US NCI’s Center for Global Health, Viet Nam 2022

“Systemic treatments for bladder cancer: state of the art", 4th Franco-Vietnamese symposium in Oncology, Ha Noi, 2023

“Perfilado molecular de células madres cancerosas en cáncer de mama localizado triple negativo (TNBC), desarrollo de un modelo pronóstico integrative”, Academia Nacional de Medicina, Buenos Aires, 2026

“Genotyping cancer stem cells on human tissue samples from metastasis biopsies to overcome treatment resistance”, THIRD FRENCH-ARGENTINE WORKSHOP ON PANCREATIC CANCER RESEARCH, Buenos Aires 2026

“Integrative and interactive genomic analyses guiding personalized combined therapy improve clinical benefit in metastatic patients: A monocentric real-life experience”, Cancer in the Era of Global Integration - Best of ASCO 2026, Hanoi 11-2026

  • COORDINATION D’ENSEIGNEMENTS

2012-2018: Coordination d’un module d’école doctorale “Targeted therapies in onco-hematology”, Paris VII

Fait tous les deux ans aux doctorants, il se concentrait sur l'enseignement des voies cancérogénétiques avec l'identification de cibles moléculaires potentielles et les implications thérapeutiques.

2016- : Co-coordination avec le Pr Philippe Bertheau d'un module d'enseignement e-learning dédié aux étudiants de premier cycle, Universités Paris VII and XIII.

Ce module d'apprentissage en ligne est un MOOC (Massive Open Online Course) dédié aux étudiants de troisième année de médecine de deux universités parisiennes, et leur enseigne l'oncologie. Il s'intitule « Stratégies diagnostiques du cancer ». Il est délivré une fois par an.

2017 : Co-coordination avec le Pr Karen Leroy d'un e-learning dédié aux internes en oncologie : « Biologie du cancer ».

2020- : Coordination d'un diplôme interuniversitaire (DIU) entre deux universités.

Ce module pédagogique, principalement dédié aux doctorants, est une extension de l'enseignement de l'école doctorale que je coordonne depuis 2012. Il s'intitule « Thérapies ciblées pour l’oncologie et les maladies inflammatoires chroniques : de la physiopathologie aux traitements, et comment rédiger un programme de recherche ».  Il implique 58 enseignants sur une période de 6 mois.

  • ORGANISATION DE RENCONTRES SCIENTIFIQUES

2018 and 2019: Co-organisation avec le Dr DAO Van Tu des deuxièmes et troisièmes rencontres franco-vietnamiennes sur les cancers du poumon et du côlon, Ha Noï, Viet Nam.

  • RESPONSABILITÉS INSTITUTIONNELLES

2014-2018: Comité scientifique de l'Université Paris VII, 2014-2018.

2019- :Conseil scientifique de l'UFR SMBH, Université Sorbonne Paris Nord

2020-2024 :Administrateur de l’Université Sorbonne Paris Nord

2020- : Membre CCP Île-de-France IV

  • ACTIVITES DE RELECTURE CRITIQUE

Membre du jury de thèse : 21 personnes, dont 11 femmes.

Membre du jury d’'Habilitation à Diriger des Recherches : 2.

Relecteur régulier pour PlosOne, Pathobiology, Neoplasia, Stem Cells, Oncotarget, Aging-US, Clinical Translational Medicine, Journal of Experimental and Clinical Cancer Research, Advanced Materials, Oncogene, Experimental Hematology & Oncology, Nature, Lancet Oncology…:  from 2014 on (10-12 revisions d’articles/an).

2021- :Guest Editor for Cancers: two special issues including one entitled “Recent Advances in Nanotechnologies for Cancer Detection and Treatment”

Expertise de subventions nationales: Cancéropôles GIRCI, CLARA, Grand Sud-Ouest, ANR

Expertise de subventions internationales: NCWR/Liverpool, 2015

  • FINANCEMENTS ET COLLABORATIONS

2009: Bourse de recherche de l’Association pour la Recherche sur les Tumeurs Rénales. PI: 30k€

2017, 2021, 2024: trois bourses des Relations Internationales de l'APHP pour les étudiants vietnamiens. PI: 90k€

2018-2022: Projet HEPPROS. Plan Cancer Physique Cancer. Co-investigator: 96k€

2019-2022: Trois Appel à Projets d’Etablissement USPN. PI and co-PI: 53k€

2019-2024: Dotation institutionnelle (Inserm, Universités). PI: 100 k€/yr

2019-2021: Collaboration industrielle, modèles animaux (Skymab), PI: 25k€

2020: Valorisation de la microdissection unicellulaire, subvention d'équipement de l'Inserm. PI: 20k€

2020-2025: 3 bourses de Thèses de Sciences dans le cadre du “Programme de bourses d’excellence”, Ambassade de France au Vietnam. PI: 270k€

2022 and 2025: International Relations Scholarship from the Sorbonne University Paris Nord (ERASMUS). PI: 38 k€

2025-2028 : PL-Bio Project STRESS-SECRET, Co-investigator: 147k€

2026: Prématuration Carnot projet Fab-ulous, co-PI avec E.Angeli: 30k€

2026: Bourse PH mi-temps recherche 24 mois (M.Fermaut), co-PI avec E.Angeli:  120k€

2026: 1 bourse de Thèses de Sciences dans le cadre du “Programme de bourses d’excellence”, Ambassade de France en Roumanie (C.Pop, 4 mois/an en France sur 3 ans). PI: 39k€

Collaborations en cours : avec des physiciens/chimistes (Pr Bruno Palpant, Ecole Centrale, Université Paris-Saclay, pour les traitements par laser pulsé ; Dr Thomas Pons, Ecole Supérieure de Physique et de Chimie Industrielle, pour l'ingénierie de nanoparticules métalliques hybrides), avec une biophysicienne sur les aspects de compression mécanique des tumeurs (Dr Claire Wilhelm, Institut Curie/CNRS), avec des pharmacologues (Pr Xavier Declèves, UPC) pour le développement préclinique d'anticorps thérapeutiques innovants..

·       PRODUCTION SCIENTIFIQUE

117 publications

- 29 in journal with IF > 7;

65 dans des journaux avec IF > 3, including 2 “highly cited”

2 Lancet Oncol, 4 J Clin Oncol, 4 Eur Urology, 1 Ann Oncology, 3 Exp Hematol Oncol, 2 Clin Cancer Res, 2 Cancer Res, 1 J Exp Clin Cancer Res,10 Oncotarget, 2 Clin Transl Med, 3 Cancers.

 

16 revues

3 éditoriaux

3 chapitres de livres.

78 en accès libre

 

> 20900 citations (Scholar)

> 5000 citations (Web of Sciences)

h-index = 36 (Scholar); 28 (WOS)

 

 

DESCRIPTION DE MES TRAVAUX DE RECHERCHE

De 2005 à 2018, j’ai appartenu à l’unité mixte Inserm et Université Paris 7 URM_S1165 du Professeur Anne Janin. Cette unité comportait en outre un Laboratoire International Associé (LIA) à Shanghai, dirigé par le Pr Zhao Weili. En janvier 2019, j’ai repris la direction de l’UMR_S1165 qui, après sa fusion avec l’ancienne UMR_S942 du Professeur Alain Cohen-Solal, est devenue une des deux équipes de l’UMR_S942 MASCOT. Je l’ai déplacée sur le site de la Faculté SMBH à Bobigny en 2019. Elle était dédiée à une recherche translationnelle visant à identifier de nouveaux biomarqueurs de la maladie métastatique, potentielles cibles thérapeutiques innovantes, ainsi que les biomarqueurs de résistance aux thérapeutiques existantes.

Mon équipe a reçu une évaluation très favorable du HCERES en 2024 pour la qualité de la production scientifique notamment, mais aussi pour l’importante dimension « relations internationales », avec d’une part le pôle sino-français à Shanghaï, créé par Anne Janin et recréé en 2024, et d’autre part la collaboration que j’ai développée avec l’Université de Médecine de Ha Noï et l’Hôpital National K du Cancer. Plus récemment, depuis 2024, j’ai étendu, au-delà de l’Asie, mon réseau international de recherche translationnelle, avec l’Université d’Oradea en Roumanie, et avec l’Argentine (Academia Nacional de Medicina, Hospital Marie Curie, et Universidad del Hospital Italiano).

J’ai ainsi contribué au développement d’une école de recherche translationnelle à la fois en France, mais aussi au niveau international. Depuis 2013, j’ai eu la responsabilité de l’encadrement de 29 étudiants en Master et la direction/codirection de 13 Thèses de Doctorat en Sciences dont 7 sont des cotutelles internationales (5 avec le Viet Nam, 1 avec la Roumanie et 1 avec l’Argentine). Parmi ces doctorants, 6 sont toujours membres de notre unité de recherche.

J’ai par ailleurs contribué à la promotion des femmes puisque deux membres de l’unité sont devenues Professeur d’Université lors du précédent contrat (Laetitia Vercellino PUPH, Mélanie di Benedetto PR), Géraldine Falgarone est devenue PUPH classe exceptionnelle, et Eurydice Angeli est Praticien Hospitalier Universitaire.

L’équipe s’est séparée de l’UMR_S942 depuis janvier 2025, et a été recréée en 09/2025 sous la forme d’une unité universitaire USPN SynKoMIC. J’en ai confié la direction administrative au Pr Géraldine Falgarone, dans l’optique d’une mission de longue durée en Argentine afin d’y implanter une antenne de notre unité de recherche. J’en suis le co-directeur pour les aspects scientifiques.

La maladie métastatique est au centre de mes recherches et de mon activité clinique en tant que cancérologue. Au cours de ma thèse de doctorat (2007-2011), je me suis formé à la pathologie expérimentale et j’ai établi des xénogreffes originales dérivées de patients à partir de biopsies de métastases de différents types de cancers. En utilisant ces modèles, j’ai développé une recherche translationnelle pour étudier la biologie des métastases, en particulier les biomarqueurs du passage des cellules cancéreuses à travers la barrière hémato-encéphalique. J’ai également identifié et étudié des biomarqueurs de la résistance aux médicaments anticancéreux, en mettant l’accent sur les cellules souches cancéreuses.

Depuis 2015, à travers des collaborations transdisciplinaires avec des physiciens et des chimistes, j’ai conçu des nanoparticules d’or multifonctionnelles hybrides ciblant les cellules cancéreuses, afin de contourner la résistance à la chimiothérapie. En 2023, une collaboration avec des mathématiciens théoriciens d’USPN a été initiée autour de la modélisation de la polygénie de faible pénétrance pour comprendre les liens génétiques entre cancers et maladies inflammatoires chroniques.

Depuis 2019, j’ai ainsi organisé mes recherches autour de 3 axes :

  1. Biomarqueurs de la maladie métastatique, passage de la barrière hémato-encéphalique, ingénierie d’anticorps

16 publications depuis 2019, 2 Thèses dont une en cotutelle internationale avec le Viet Nam. Une Thèse à venir d’un jeune neurochirurgien italien.

5 publications majeures (sont soulignés les noms de mes étudiants, * co-senior):

La première a montré la faisabilité de l’administration intrathécale de trastuzumab guidée par la pharmacologie pour le traitement des métastases cérébrales de cancers du sein HER2. La mise en évidence d’un efflux important du cerveau vers le sang a conduit à un programme de recherche sur l’ingénierie d’un Fab du trastuzumab pour contourner l’efflux. Un brevet a été déposé (n° EP23307089.5, dépôt le 29/11/2023), avec la publication sur la preuve de concept de l’efficacité d’un Fab anti-HER2 après injection intra-thécale (E.Angeli et al, Experimental Hematology & Oncology 2024. Apr 15;13(1):41. doi: 10.1186/s40164-024-00513-7. – IF: 13,5 (rank Q1, 19/333 Oncology). Une collaboration est initiée depuis 2024 avec l’Agence Générale des Équipements de des Produits de Santé (AGEPS) pour la mise au point d’une formulation à libération prolongée (Prix Ruban Rose obtenu par Eurydice Angeli, financement prématuration Carnot de la DRCI/APHP). Eurydice Angeli déposera une ERC Starting Grant en 10/2026 visant à amener le développement du Fab formulé au plus proche d’une phase I dédiée (collaboration avec l’AGEPS, et avec le CEA pour l’utilisation de primates).

Bousquet G, Darrouzain F, de Bazelaire C, Ternant D, Barranger E, Winterman S, Madelaine-Chambin I, Thiebaut JB, Polivka M, Paintaud G, Culine S, Janin A: Intrathecal Trastuzumab Halts Progression of CNS Metastases in Breast Cancer. J Clin Oncol 2016, 34:e151-5, doi.org/10.1200/JCO.2012.44.8894 – IF: 24 (rank Q1, 5/230 Oncology)

E Angeli, J Paris, O Le Tilly, C Desvignes, G Gapihan, D Boquet, F Pamoukdjian, D Hamdan, M Rigal, F Poirier, D Lutomski, F Azibani, A Mebazaa, A Herbet, A Mabondzo, G Falgarone, A Janin, G Paintaud, G Bousquet. A Fab of trastuzumab to treat HER2 overexpressing breast cancer brain metastases. Experimental Hematology & Oncology 2024. Apr 15;13(1):41. doi: 10.1186/s40164-024-00513-7. – IF: 13,4 (rank Q1, 19/326 Oncology).

Dans le cadre de mon réseau international, avec nos deux laboratoires à Shanghaï et à Ha Noi, nous avons mené un travail original d’établissement d’une signature moléculaire commune des métastases cérébrales des cancers du sein, des mélanomes et des lymphomes, à la fois à partir d’une cohorte exceptionnelle de patients avec métastases cérébrales et biopsies congelées, et à partir de modèles animaux pour confirmer l’intérêt de la surexpression de KLK6 pour l’implantation de ces métastases, indépendamment du type de tumeur.

TT Nguyen, DM Hoang, TV Nguyen, F Pamoukdjian, L Wang, M Battistella, C Miquel, CLebbé, QV Le, WL Zhao, A Janin, JP Feugeas, G Bousquet. A common signature of brain metastases among patients with breast cancer, melanoma and lymphoma. Neuro-oncology Advances 2026. doi: 10.1093/noajnl/vdag125 – IF: 4,6 (rank Q1, 48/296 Clinical Neurology).

Les autres publications d’importance ont permis d’identifier PROM2 comme biomarqueur du risque métastatique à distance et surtout cérébral chez l’homme avec mélanome métastatique ganglionnaire. S’en est suivi un travail biologique et mécanistique confirmant le lien entre surexpression de PROM2 dans le mélanome et augmentation du risque métastatique associé à une résistance à la ferroptose, et un dépôt à venir d’un PLBio autour de l’étude des exosomes PROM2+ et l’hypothèse qu’ils préparent la niche pré-métastatique, collaboration avec le Pr C.Lebbé et l’unique cohorte MelBASE.

En parallèle, nous développons avec l’UFR de Chimie de Jussieu (Pr S.Boujday, Thèse bi-disciplinaire de L.Blayac que je co-dirige) des nanopyramides d’or sur lesquelles sont greffées des oligonucléotides antisens anti-PROM2 pour traiter, en combinaison avec la photothérapie, des mélanomes résistants.

Enfin, avec Claire Wilhelm, biophysicienne de renom au CNRS/Curie et avec qui je collabore depuis plusieurs années, nous étudions l’impact de la compression physique des tumeurs sur l’augmentation du risque métastatique, et notamment d’implication des vésicules extra-cellulaires. Nous avons déposé en septembre 2026 une ERC+ à cet effte.

Nguyen TT, Gapihan G, Tetu P, Pamoukdjian F, El Bouchtaoui M, Lebœuf C, Paris J, Baroudjian B, Delyon J, Mourah S, Lebbé C, Janin A, Battistella M*, Bousquet G*. Increased risk of brain metastases in patients with melanoma and PROM2 expression in metastatic lymph-nodes. Clinical and Translational Medicine 2020 Dec;10(8):e198. doi: 10.1002/ctm2.198 – IF: 11,492 (rank Q1 22/195 Medicine, Research & Experimental).

J Paris, C Wilhelm, C Lebbé, F Pamoukdjian, G Gapihan, A Van De Walle, NV Tran, D Hamdan, G Falgarone, C Allayous, M Battistella, E Van Glabeke, K Wai Lim, C Leboeuf, A Tuan Phan, G Bousquet. PROM2 overexpression is associated with metastatic potential linked to EMT phenotype and ferroptosis resistance in human cancers. Clinical and Translational Medicine 2024 Mar;14(3):e1632. doi: 10.1002/ctm2.1632. – IF: 7,9 (rank Q1 24/195 Medicine, Research & Experimental).

 

  1. Biomarqueurs de résistance aux anti-cancéreux, cellules souches, ingénierie de nanoparticules

9 publications depuis 2019, 4 Thèses dont une en cotutelle internationale avec le Viet Nam, et une thèse bi-disciplinaire en 2024 avec une jeune chimiste de Sorbonne Université (bourse bi-disciplinaire)

3 publications majeures montrant le rôle des cellules souches dans la résistance aux traitements, et la faisabilité d’approches transdisciplinaires avec l’ingénierie de nanoparticules métalliques pour un ciblage actif, mais aussi pour utiliser la production d’espèces réactives de l’oxygène sous irradiation lumineuse (lasers impulsionnels) afin d’induire la seule mort des cellules cancéreuses.

Varna M, Gapihan G, Feugeas JP, Ratajczak P, Tan S, Ferreira I, Leboeuf C, Setterblad N, Duval A, Verine J, Germain S, Mongiat-Artus P, Janin A, Bousquet G: Stem cells increase in numbers in perinecrotic areas in human renal cancer. Clin Cancer Res 2015, 21:916-24, doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-14-0666 – IF:10.1 (rank Q1 10/290 Oncology)

T Nunes, T Pons, XHou, K Van Do, B Caron, M Rigal, M Di Benedetto, B Palpant, C Leboeuf, A Janin, G Bousquet. Pulsed-laser irradiation of multifunctional gold nanoshells to overcome trastuzumab resistance in HER2-overexpressing breast cancer. Journal of Experimental and Clinical Cancer Research 2019 Jul 12;38(1):306. doi: 10.1186/s13046-019-1305-x – IF: 11.16 (rank Q1 25/318 Oncology)

L Tourneur, S Gueffrache, K Van Do, Y Lalatonne, E Guénin, D Hamdan, C Comte, A Marsocci, B Caron, E Van Glabeke, S Marguet, C Leboeuf, B Palpant, G Bousquet. Combined photothermal and photodynamic therapy using pulsed-laser irradiation of gold nanoparticles for the treatment of cancers with high basal oxidative stress Nano Letters 2025. DOI:10.1021/acs.nanolett.5c03580 – IF: 9,1 (rank Q1, 28/241 Chemistry Multidisciplinary).

 

3 publications autour des analyses génomiques des métastases de cancers pour identifier de nouvelles cibles thérapeutiques potentielles, dont deux approches méta-analytiques originales, et l’identification par ailleurs d’une mutation de NOTCH1 jusqu’alors jamais identifiée dans les cancers du rein à cellules claires métastatiques. Ce dernier travail a fait l’objet de développement pré-clinique d’un nouvel inhibiteur de NOTCH1, le CB-103, original dans son mécanisme d’action. Un essai de phase I est en cours de demande de financement (FREEDOM), en deuxième ligne métastatique des cancers du rein, et conditionné par la présence de la mutation.

Sur le plan translationnel, le Dr HOANG Manh Duc, en Thèse en co-tutelle internationale, a mis au point une approche unique et complexe de microdissection laser sur coupe de cellules souches de cancers du rein et mélanomes résistants aux traitements standards, pour en faire le génotypage à haut débit.

Avec Eurydice Angeli, et nos différents sites internationaux de recherche translationnelle (Viêt Nam, Roumanie, Argentine), nous développons un programme PRIMe-TNBC de génotypage des cellules souches de cancers du sein triple négatif de patientes traitées en néoadjuvant et résistantes à l’immunochimiothérapie. Ce projet effectué sur tissu fixé FFPE et de petites quantités de cellules microdisséquées constitue un authentique enjeu technologique que nous menons avec la société Intergagen®, et dont les retombées pourraient être majeures en termes d’utilisation de tissus fixés en formol. Avec l’Université d’Oradea en Roumanie et la thèse en cotutelle d’une jeune pathologiste Caleb Pop (bourse Excellence de l’Ambassade de France), nous avons associé un axe de pathologie computationnelle dans l’optique d’une recherche pleinement intégrative.

Bui TO, Dao VT, Nguyen VT, Feugeas JP, Pamoukdjian F, Bousquet G. Genomics of renal cell carcinoma: a systematic review and meta-analysis. European Urology 2022 Apr;81(4):349-361. doi: 10.1016/j.eururo.2021.12.010. Epub 2022 Jan 3 – IF: 23,4 (rank Q1 2/124 Urology & Nephrology)$ highly cited paper

Bui TO, El Bouchtaoui M, Gapihan G, Feugeas JP, Leboeuf C, Ziol M, Van Glabeke E, Janin A, Bousquet G. A new NOTCH1 activating mutation in metastatic clear-cell renal cell carcinoma predictive for response to NOTCH1 inhibition. Experimental Hematology & Oncology 2023. May 15;12(1):46. doi: 10.1186/s40164-023-00408-z – IF: 10,9 (rank Q1, 42/317 Oncology).

MD Hoang, TO Bui, VT Dao, VQ Le, C Lebbé, G Bousquet. Genomics of primary and metastatic cutaneous melanoma: a systematic review and meta-analysis. American Journal of Clinical Dermatology 2026. doi.org/10.1007/s40257-026-01031-4 – IF: 11,4 (rank Q1, 2/99 dermatology).

 

  • Inflammation chronique et cancer, immunité et liens génétiques

4 publications depuis 2019, 3 Thèses dont une inscription en 2023 d’une jeune mathématicienne sur une Thèse bi-disciplinaire et l’obtention d’une bourse bi-disciplinaire d’USPN.

Cette troisième thématique, co-dirigée avec le Pr Géraldine Falgarone, immuno-rhumatologue, est émergente et repose sur une première étude preuve de concept d’une approche individuelle en génétique constitutionnelle, et dans laquelle j’ai démontré pour la première fois un lien génétique entre cancers et maladies auto-immunes.

A partir d’un registre clinique, plusieurs patients/familles ont été identifiés avec des associations polypathologiques non syndromiques, et vont faire l’objet d’analyses génétiques à haut débit sur des prélèvements tumoraux et des ADN constitutionnels. Cette thématique soulevant la question de la polygénie nous conduit à travailler avec des mathématiciens sur des systèmes de modélisation, ouvrant un pan considérable de la recherche et de l’identification de nouvelles cibles thérapeutiques.

Pour l’instant, 4 publications essentielles depuis 2019 :

El Bouchtaoui M, Do Cruzeiro M, Leboeuf C, Loisel-Ferreira I, Fedronie C, Ferreira C, Ait El Far R, Ziol M, Espie M, Falgarone G, Cassinat B, Kiladjian JJ, Feugeas JP, Janin A, Bousquet G: A Constitutional Activating MET Mutation Makes the Genetic Link between Malignancies and Chronic Inflammatory Diseases. Clin Cancer Res 2019, doi.org/10.1158/1078-0432.CCR-18-3261 – IF:10.1 (rank Q1 13/308 Oncology)

D Hamdan, VT Nguyen, J Paris, G Falgarone, C Leboeuf, M El Bouchtaoui, M Espié, A Janin, M Di Benedetto, G Bousquet. The germline genetics of mild-to-moderate penetrance: an intriguing role of PRAME in multiple carcinogenesis. Genes & Diseases 2023 – IF: 9,4 (rank Q1 7/191 Genetics & Heredity).

KL Vomo Donfack, B Gönüllu, F Pamoukjian, E Angeli, A Macchia, G Ginot, I Morilla, G Falgarone, G Bousquet*. Deciphering pathophysiological links between woman cancers, cardiovascular and inflammatory chronic diseases using structural equation modeling. Scientific Reports 2026 – IF: 4,9 (rank Q1, 21/140 Multidisciplinary Sciences) (in revision).

KL Vomo Donfack, G Bousquet, G Falgarone, G Ginot, I Morilla. Topological deep learning identifies polygenic variant clusters across familial multimorbid disorders (submitted).